Tomato leaf curl Mayotte virus

Меню

Первый семестр

Второй семестр

Ссылки

(Вирус курчавости томатных листьев Майотта относится к бегомовирусам)

Индентификатор записи последовательности полного генома вируса из банка RefSec NC_006876.
Длина генома 2768 пар оснований.

Гены в геноме вируса

Tomato leaf curl Mayotte virus содержит одну кольцевую молекулу ДНК, которая кодирует 6 белков. Из них два белка закодированы прямыми последовательностями ДНК (от 5'-конца к 3'-концу) и 4 обратными, т.е. закодированы на ДНК, комплиментарной исходной. С обоих концов ДНК находятся некодирующие участки. Их функция не установлена.

Рисунок 1. Изображение полного генома вируса Tomato leaf curl Mayotte virus (идентификатор NC_006876).
Координаты демонстрируемого участка 1..2768 (первый и последний нуклеотид генома соответственно).
Рисунок получен с помощью геномного браузера сайта NCBI: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ .

Гены могут перекрываться. А так же находиться один внутри другого. На рисунке 1 справа можно увидеть один ген внутри другого и несколько перекрываний генов. Одно из перекрываний изображено в крупном масштабе на рисунке 2.

Рисунок 2. Перекрытие генов, кодирующих белок капсида и усиливающий репликацию белок (c индентификаторами YP_213940.1 и YP_213941.1 соответсвенно) в геноме вируса Tomato leaf curl Mayotte virus (идентификатор NC_006876).
Координаты демонстрируемого участка: 1050..1089. В верней части рисунка изображены все гены этого вируса. В нижней части линии трёх цветов : серые - прямая и обратная цепи ДНК, зелёные - цепи мРНК, с которых транслируются белки, красные - цепи аминокислот, кодирующие белки.
Рисунок получен с помощью геномного браузера сайта NCBI: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ .