Краткое описание генома вируса "Broad bean mottle virus"

Русское название вируса: Вирус пятнистости (крапчатости) конских бобов (или кормовых бобов).
Объект поражения: конские (кормовые) бобы - Vicia faba, горох посевной -  Pisum sativum. 
Регионы распространения: Африка, Европа, Азия, Австралия.
Страны (с наибольшим уровнем распространения): Португалия, Судан и Великобритания.[1]
Симптомы вируса достаточно сложно отличить от вирусов Broad bean stain virus и broad bean true mosaic virus.
Все три вируса могут быть распространены с помощью долгоносиков.
Некоторые виды и симптомы:
1) Vicia faba – системная пятнистость; время проявления симптомов: 2-4-7 дней.
2) Pisum sativum – увядание, приводящее к летальному эффекту; время проявления симптомов: 2-3 дня.
3) Nicotiana clevelandii – умеренная пятнистость.[2]
В таблице 1 приведены некоторые важные количественные и качественные показатели, характеризующие вид "Broad bean mottle virus".
   

Таблица 1. Основные параметры генома вируса "Broad bean mottle virus"

Параметр Значение
Латинское название вируса Broad bean mottle virus
Русское название вируса Вирус пятнистости (крапчатости) конских бобов (или кормовых бобов
Количество фрагментов в полном геноме 3
Общая длина генома (п.н.) 8250
Количество кодируемых в геноме белков 4

>AAA42741.1 2a protein
MSKFVAADEYIVPSFQWLLGPTSSQVESFDSSVAGWIKRYEDESKRPESTVDGSCESFVL
AVKPVMIGGQCEPAYDQAKWAETCLNVTNLASGLTGVRLIPLPEMARMIYLDEEDSFVDE
SEVDDWYPEDTSDGFEYLSADGSDYHQNSEPEEEVLDKSNGTLESEEARHETDVKSICSF
RDIPVETTMGHRYLALSEEFASIEVDYQVSSIVTPLNKGSIYMTLDVHEETHPKSGIQDK
ASIERLEAAGHNALKTHAYFDDSYYEGFEESADFSSDFQRLKIKQSHVDWYKDPDKFFEP
VLNFGASSRRVGSQKTVLTALKKRNADVPELSDVVDATEVPICLRQSYLNIYGADCLFES
FNIMAKGLDYHKRWKSHKELQGVTLLCETNLQRYQHMIKSDVKPTVTDTLHVERDVPATI
TFHGKGVTSCFSPFFTACFEKFSLALRESIYVPIGKISSLELKSKALNNKFFLEADLSKF
DKSQGELHLEFQRLILINLGFPVPLTNWWCDFHRSILSRWTLRPGVSIPLLSKTNRGCFH
LLWEHFSDNAMMAYCFDMSTAELAMFSGDDSLVICGSKPEFDPGVFQSLFNMEVKVMDPS
LPYICSKFLLESEFGDVFSVPDPMREIQRLQKRKIPKDVQVLRADFDSFCDRMKFLDRLS
ELSLSVLCRLTALKYCKPGIEGDVRAWLSGFAYYRENFLRYSECYVTDGIHCYRRVDPMS
RFKPIDKFQRSDKEWFHDWRNNEFPKKPIDKMARMFGAYKGPVNNDRVERKAKYKVNAAM
HDPFALAYERRYVQELELKNDKGNCSVLRE 

© Kalashnikova Anastasia, 2015