Uniprot и Refseq Protein

Таблица 1. Общая информация о белке с RefSeq ID - YP_005889234.1

*Параметр*	*Значение*
Uniprot ID	Q5F9M9_NEIG1
Uniprot AC	Q5F9M9
Refseq ID	WP_003687776.1, YP_207520.1
PDB ID	4RCT, 4RD5, 4RDM
Длина	345 AA
Молекулярная масса	39837 MW
Рекомендуемое Unirpot название	Restriction endonuclease NgoFVII

Комментарии к таблице: В записях PDB структура представлена 2 цепями. Статус - Unreviewed.

Для получения данных я воспользовалась сайтом Uniprot (PDB ID - воспользовалась для поиска).

Таблица 2. Описание кластеров

*Идентификатор кластера*	*Количество белков*	*Аспекты, заслуживающие внимание*
Uniref50_Q5F9M9	22	Две трети видов( 15 из 22 представленных), что имеют этот кластер, относятся к одному роду.
Uniref90_Q5F9M9	14	Пятая часть организмов принадлежит к другому роду, а из оставшихся - все, за исключением одного организма, относятся к одному виду.
Uniref100_Q5F9M9	4	Все организмы принадлежат к одной группе.

Таблица 3. Результаты сеансов поиска в Unirpot

*Текст запроса*	*Количество белков*	*Белки из раздела Reviewed*
name:restriction endonuclease ngofvii	142	1
name:restriction endonuclease ngofvii taxonomy:neisseria	8	1
name:restriction endonuclease ngofvii taxonomy:proteobacteria	45	1
name:actin	45955	1121
name:actin taxonomy:metazoa	16598	642
name:actin taxonomy:vertebrata	8246	491
name:trypsin	11134	301
name:trypsin name:inhibitor	2791	203

Как мы можем заметить, поиски по рекомендованному названию моего белка, семейству и отделу, к которым принадлежит организм с моим белком, показали наличие всего одного белка из раздела Reviewed. Поиск "actin" выдает примерно 2.4% белков из раздела Reviewed от всех найденных белков. Также, данный поиск выдает наибольшее число найденных белков из всех проведенных мной поисков. Группа "Metazoa" имеет 3.9% Review белков, а "Vertebrata" - 6%. Последние два примера иллюстрируют, что нам необходимо конкретизировать наш поиск, иначе можем получить неверные результаты.