Таблица 1. Краткое описание протеомов
| Название организма | Идентификаторы протеома | Число последовательностей | Число остатков |
| Neisseria gonorrhoeae (strain ATCC 700825 / FA 1090) | UP000000535 | 2106 | 571507 |
| Escherichia coli MG1655 | UP000000625 | 4306 | 1356086 |
Я взяла другой штамм своей бактерии, так как не нашла протеома выданного штамма бактерии.
Таблица 2. Частоты остатков в протеомах
| Oстаток (однобуквенный код) | Процент остатка в протеоме Neisseria gonorrhoeae (strain ATCC 700825 / FA 1090) | Процент остатка в протеоме E. coli K12 | Разность процентов |
| A | 10,281% | 9,515% | 0,766% |
| L | 9,735% | 10,673% | -0,938% |
| G | 7,896% | 7,375% | 0,521% |
| V | 6,780% | 7,073% | -0,293% |
| E | 6,164% | 5,763% | 0,401% |
| I | 5,734% | 6,010% | -0,276% |
| R | 5,721% | 5,511% | 0,21% |
| K | 5,674% | 4,406% | 1,268% |
| S | 5,424% | 5,802% | -0,378% |
| D | 5,267% | 5,151% | 0,116% |
| T | 5,069% | 5,399% | -0,33% |
| P | 4,330% | 4,425% | -0,095% |
| F | 4,162% | 3,890% | 0,272% |
| N | 4,007% | 3,945% | 0,062% |
| Q | 3,838% | 4,440% | -0,602% |
| Y | 2,966% | 2,845% | 0,121% |
| M | 2,503% | 2,819% | -0,316% |
| H | 2,162% | 2,266% | -0,105% |
| W | 1,181% | 1,531% | -0,350% |
| C | 1,103% | 1,158% | -0,054% |
| U | - | 0,0002% | -0,0002% |
Комментарии к таблице:
1) 3 самых частых остатка: Neisseria gonorrhoeae (strain ATCC 700825 / FA 1090) - A, L, G; E.coli K12 имеет те же самые остатки в качестве самых частых.
2) 3 самых редких остатка: Neisseria gonorrhoeae (strain ATCC 700825 / FA 1090) - W, C и U( селеноцистеин не входит в состав протеома); E.coli K12 имеется те самые остатки в качестве самых редких, только у нее есть в наличии селеноцистеин.
3) Самая большая разница разностей по абсолютной величине наблюдается для лизина (1,268%).
© Kalashnikova Anastasia, 2016