В данном задании было необходимо выбрать 7 бактерий из списка и поработать с их филогенетическим деревом.
Выбранные мной бактерии представлены в таблице 1 (их названия, мнемоника).
Данное дерево содержит 4 нетривиальные ветви (их список приведен ниже).
Скобочная формула дерева: (CLOTE, ((BACAN,BACSU), ((LACAC, LACDA), (STRPN, STRP1))));
Список нетривиальных ветвей:
{BACAN, BACSU} vs {CLOTE, LACAC, LACDA, STRPN, STRP1};
{LACAC, LACDA} vs {CLOTE, BACAN, BACSU, STRPN, STRP1};
{STRPN, STRP1} vs {CLOTE, LACAC, LACDA, BACAN, BACSU};
{LACAC, LACDA, STRPN, STRP1} vs {CLOTE, BACAN, BACSU}.
Таблица 1. Выбранные бактерии
Название | Мнемоника |
Bacillus anthracis | BACAN |
Bacillus subtilis | BACSU |
Clostridium tetani | CLOTE |
Lactobacillus acidophilus | LACAC |
Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus | LACDA |
Streptococcus pyogenes serotype M1 | STRP1 |
Streptococcus pneumoniae serotype 4 | STRPN |
Рис. 1 - Изображение дерева