Результаты выдачи blastn для исследуемой последовательности вы можете видеть ниже.
Выдача по семейству Loxosomatidae:
 |
| Рис. 1. Результаты выдачи blastn |
 |
| Рис. 2. Фрагмент выравнивания |
Ген 18s рибосомальной РНК (18S ribosomal RNA gene, partial sequence).
Предположительная таксономия организма: Eukaryota; Metazoa; Lophotrochozoa; Entoprocta; Loxosomatidae; Loxosomella
Ссылка на проект Jalview
Сравните списки находок нуклеотидной последовательности 3-я разными алгоритмами blast
 |
| Рис. 3. Выдача megablast |
 |
| Рис. 4. Выдача megablast discontiguous |
 |
| Рис. 5. Выдача blastn |
Проверка наличия гомологов трех белков в геноме одного организмов
Таблица со скэффолдами.
Ген белка, закодированный в одном скэффолде "Amoeboaphelidium protococcarum"
 |
| Рис. 6. Выдача blastx |
 |
| Рис. 7. Выдача blastx |
