Краткое описание генома бактерии Helicobacter pylori Rif2

Известно несколько штаммов Helicobacter pylori, и геном трех из них полностью секвенирован. Мутантный штамм Rif2, устойчивый к рифампицину, был выведен и исследован in vitro. Исходный для него штамм - Helicobacter pylori 26695.

Геном штамма «26695» представлен кольцевой двуцепочечной молекулой ДНК размером 1667867 пар оснований, и содержит 1630 генов, из которых 1576 кодируют белки, доля Г+Ц пар составляет 38 моль %. Геном штамма «J99» представлен кольцевой двуцепочечной молекулой ДНК размером 1643831 пар оснований, и содержит 1535 генов, из которых 1489 кодируют белки, доля Г+Ц пар составляет 39 моль %. Два изученных штамма демонстрируют значительные генетические различия, до 6 % нуклеотидов у них различны. Геном мутантного штамма был отсеквенирован 15 октября 2012.

Helicobacter pylori — спиралевидная грамотрицательная бактерия, которая инфицирует различные области желудка и двенадцатиперстной кишки. Многие случаи язв желудка и двенадцатиперстной кишки, гастритов, дуоденитов, рака желудка и, возможно, некоторые случаи лимфом желудка этиологически связаны с инфекцией Helicobacter pylori.^[1] Микрофотография изображена на рисунке 1.

Рисунок 1

Рисунок взят с https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d6/EMpylori.jpg/530px-EMpylori.jpg

^[1] https://ru.wikipedia.org/wiki/Helicobacter_pylori