EMBOSS

Сравнение двух полных протеомов бактерий.

Организм Proteome ID Число последовательностей Число остатков
Helicobacter pylori 26695 UP000000429 1553 482953
Escherichia coli (штамм K12) UP000000625 4306 1356086

Остаток Процент в Helicobacter pylori 26695 Процент в Escherichia coli (штамм K12) Разность процентов
L 11,42 10,7 0,72
K 9,1 4,41 4,69
I 7,33 6,01 1,32
E 7,02 5,76 1,26
A 6,97 9,51 -2,54
S 6,94 5,8 1,14
N 5,92 3,95 1,97
G 5,89 7,37 -1,48
V 5,71 7,07 -1,36
F 5,52 3,89 1,63
D 4,86 5,15 -0,29
T 4,45 5,4 -0,95
Q 3,77 4,44 -0,67
Y 3,75 2,85 0,9
R 3,51 5,51 -2
P 3,35 4,43 -1,08
M 2,33 2,82 -0,49
H 2,16 2,27 -0,11
C 1,12 1,16 -0,04
W 0,72 1,53 -0,81
U 0 0,00000221 -0,00000221

Наиболее часто встречающиеся остатки кардинально различаются в двух протеомах. Только лейцин и там, и там на первом месте. А вот мало встречающиеся остатки, несколько более консервативны. Самая большая разница по абсолютной величине для лизина и составляет 4.69%.

Term 2


© Artemiy Polozhintsev (Артемий Положинцев) 2016