Практикум 9

Множественное выравнивание и выявление негомологичной последовательности

Были даны идентификаторы 6ти последовательностей:
    GCSH_MICLC
    A0ZGP6_NODSP
    A0A0D3DKT0_BRAOL
    I3J193_ORENI
    B4EU64_PROMH
    V9WCC9_9BACL
Были скачаны белки из UniProt и импортированы в Jalview в котором было построено множественное выравнивание.
    Далее был произведен анализ гомологии используя раскраску BLOSUM62 с порогом по консервативности 30%. При удалении последовательности B4EU64_PROMH появилось наибольшее количество консервативных колонок, что свидетельствует в пользу её удаления.
Выравнивание FASTA
Выравнивание MSF
    Проект Jalview JVP
Term 2


© Artemiy Polozhintsev (Артемий Положинцев) 2016