Было филогенетическое дерево из данного списка бактерий. Оно представлено на рисунке ниже.
Далее были выбраны 8 бактерий, чьи названия и мнемоники представлены в таблице ниже.
Были выбраны бактерии:
Bacillus subtilis | BACSU |
Clostridium botulinum | CLOBA |
Clostridium tetani | CLOTE |
Finegoldia magna | FINM2 |
Lactobacillus acidophilus | LACAC |
Listeria monocytogenes serovar 1/2a | LISMO |
Staphylococcus epidermidis | STAES |
Streptococcus pneumoniae serotype 4 | STRPN |
По ним было построено филогенетическое дерево.
Скобочная формула для него:
((FINM2,(CLOTE,CLOBA)),((LACAC,STRPN),(STAES,(BACSU,LISMO))));Ссылка на дерево
Список нетривиальных ветвей:
{CLOTE, CLOBA}----{FINM2, LACAC, STRPN, BACSU, LISMO, STAES} {CLOTE, CLOBA, FINM2}----{LACAC, STRPN, BACSU, LISMO, STAES} {LACAC, STRPN}----{CLOTE, CLOBA, FINM2, BACSU, LISMO, STAES} {BACSU, LISMO}----{CLOTE, CLOBA, FINM2, LACAC, STRPN, STAES} {BACSU, LISMO, STAES}----{CLOTE, CLOBA, FINM2, LACAC, STRPN}
Далее по сайту NCBI была проверена филогения бактерий и выделяют ли нетривиальные ветви какие-нибудь из таксонов.
Bacillus anthracis | Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus; Bacillus subtilis group |
Clostridium botulinum | Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium |
Clostridium tetani | Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium |
Finegoldia magna | Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Tissierellia; Tissierellales; Peptoniphilaceae; Finegoldia |
Lactobacillus acidophilus | Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Lactobacillaceae; Lactobacillus |
Listeria monocytogenes serovar 1/2a | Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Listeriaceae; Listeria |
Staphylococcus epidermidis | Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Staphylococcaceae; Staphylococcus |
Streptococcus pneumoniae serotype 4 | Bacteria; Terrabacteria group; Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Streptococcaceae; Streptococcus |
Нетривиальные ветви:
Ветвь, относящаяся к одному таксону | Объединяющий таксон | Ранг объединяющего таксона |
---|---|---|
{CLOTE, CLOBA} | Clostridium | Род |
{LACAC, STRPN, BACSU, LISMO, STAES} | Bacilli | Класс |
{LACAC, STRPN} | Lactobacillales | Порядок |
{BACSU, LISMO, STAES} | Bacillales | Порядок |