На главную


Асимметрические единицы

Биологическая единица - структура белка, в которой он выполняет свои "природные" функции (по мнению авторов). Биологическая единица может быть частью асимметрической единицы, может совпадать с ней, а также может состоять из нескольких асимметрических единиц. Асимметрическая единица - это минимальная часть молекулы, к которой можно применить преобразования симметрии такие, что кристалл переходит сам в себя (Рис.1).

Рис.1. Асимметрическая единица (https://pdb101.rcsb.org/learn/guide-to-understanding-pdb-data/biological-assemblies)
В качестве примера биологической единицы, состоящей из нескольких асимметрических единиц, можно рассмотреть белок 6V45. Биологическая единица этого белка представлена 2-мя асимметрическими единицами. На рисунке 2 представлена иллюстрация. Сверху - биологическая единица с проведенной зеленым цветом осью симметрии.

Рис. 2. Биологическая единица, состоящая из двух асимметрических единиц
В качестве примера биологической единицы, являющейся частью асимметрической единицы, мне удалось найти белок 6IWF. Этот белок может функционировать как гетеродимер, составные части которого представляют собой независимые функциональные биологические единицы.

Рис. 3. Биологическая единица, являющаяся частью асимметрической единицы
Поиск проводился с использованием advanced search PDB.