PR5

Каталитически активный центр

Код фермента: EC 3.4.22.69. Протеаза коронавируса SARS является ключевым ферментом в процессинге полипротеинов репликазы коронавируса SARS.
Основная протеаза коронавируса SARS является ключевым ферментом в процессинге полипротеинов репликазы коронавируса SARS. TSAVLQ-|-SGFRK-NH2 и SGVTFQ-|-GKFKK - два пептида, соответствующие двум сайтам саморасщепления SARS 3C-подобной протеазы, являются двумя наиболее реактивными пептидными субстратами. Фермент проявляет сильное предпочтение к субстратам, содержащим Gln в положении P1 и Leu в положении P2.

В состав каталитического центра входят CYS-145 и HIS-41 (обозначены красным цветом). Напрямую между ними связей нет. На расстоянии до 5 ангстрем каталитического центра аминокислоты связаны в основном водородными связями.

cat
Рис. 1. Каталитический центр белка(красным цветом) и аминокислоты на расстоянии до 5ангстрем (подписаны).
7
Рис. 2. Ингибитор.

Ингибитором является лиганд TOW-405.