Выбор белка

Объектом моего прошлого исследования была бактерия из рода Halomonas - Halomonas Venusta. В своей работе я выбрал один из белков бактерии Halomonas Venusta для описания. Мой выбор пал на Рибонуклеазу-E в силу наибольшей аннотированности.

Запрос для поиска для поиска белка производился на сайте uniprot.org. Он был составлен следующим образом: Поисковая строка > Advanced > Organism [OS] > 44935.

Краткая информация о белке

Название: Ribonuclease E

Организм: Halomonas Venusta

Аннотированность: 4/5

Функция: Играет центральную роль в процессинге и распаде РНК. Необходима для подготовления к синтезу 5S и 16S рРНК и большинства тРНК. Также участвует в распаде большинства мРНК.

Длина последовательности: 1197

Кластеры похожих белков

Для поиска кластеров белков был использован ID mapping.

Поисковые запросы

1. Распространение белка Ribonuclease E в других организмах (не включая род Halomonas). (protein_name:"Ribonuclease E") NOT (taxonomy_id:2745)

2. Mg²⁺ кофакторы белков для рода Halomonas. (taxonomy_id:2745) AND (cc_cofactor_chebi:"CHEBI:18420")

3. Длина белков организма Halomonas Venusta более 5000 ангстрем. (organism_id:44935) AND (length:[5000 TO *])

4. Ферменты с аллостерической регуляцией у организма Halomonas Venusta. (organism_id:44935) AND (cc_activity_regulation:allosteric)