Доменная структура белка PDUO_BACSU по данным Pfam
Cхема из Pfam: |
|||||
| Пояснения к схеме |
|||||
| № | Pfam AC | Pfam ID | Полное название семейства доменов | Положение в последовательности белка PDUO_BACSU | клан |
| 1 | PF01923 | отсутствует | Кобуриновая к-та a,с-диамин аденозилтрансфераза (фермент, катализирующий реакцию превращения кобаламина(витамин В12) в аденокобаламин(коэнзим В12)) | 3-168 | отсутствует |
| 2 | участок низкой сложности | 124-137 | |||
Домен
- Домен входит в 7 архитектур
- Известны 2037 последовательностей, содержащих домен
- Пространственная структура известна для 7 разных белков(включающих 27 цепей)
ссылка на выравнивание доменов
В выравнивании есть несколько очень консервативных участков, около 10% аминокислот одинаковы более чем у девяноста процентов доменов, что, безусловно, говорит об их гомологии
Доменная архитектора
В моем белке только один домен, так что я выбрал архитектуру, где есть два домена, один из которых - домен моего белка.
|
Таксон
|
Количество белков с доменом DUF336
|
||||||||||||||||||||||
| Эукариоты | Зеленые растения | 3 | |||||||||||||||||||||
| Грибы | 72 | ||||||||||||||||||||||
| Животные | 0 | ||||||||||||||||||||||
| Остальные эукариоты | 3 | ||||||||||||||||||||||
| Археи | 21 | ||||||||||||||||||||||
| Бактерии | 1602 | ||||||||||||||||||||||
| Вирусы | 0 | ||||||||||||||||||||||
|
Таксон
|
Количество белков с доменом PF01923
|
|
| Эукариоты | Зеленые растения | 0 |
| Грибы | 2 | |
| Животные | 41 | |
| Остальные эукариоты | 10 | |
| Археи | 84 | |
| Бактерии | 1869 | |
| Вирусы | 0 | |
InterPro
Все мотивы - об одном и том же, но из разных баз данных, так, самый короткий - 13-187 из БД Gene 3D - 1.20.1200.10, а самый длинный - 1-187 из БД panther - 1,3-PROPANEDIOL DEHYDROGENASE-RELATED
Все структурные домены из разных БД отличаются от Pfam незначительно, всегоо на несколько аминокислот в начале и несколько - в конце