Второй семестр

Мотивы в белке GLMU_ECOLI, описанные в БД Prosite

Описание мотивов белка GLMU_ECOLI (по данным БД PROSITE ).

Идентификатор документа PROSITE (AC) Название мотива Краткое описание мотива Тип подписи (паттерн, профиль) Паттерн (регулярное выражение) Специфична ли подпись? Сколько мотивов нашлось в белке?
 PS00101  HEXAPEP_TRANSFERASES  Подпись гексапептидтрансфераз(Hexapeptide-repeat containing-transferases signature)  паттерн  [LIV]-[GAED]-x(2)-[STAV]-x-[LIV]-x(3)-[LIVAC]-x-[LIV]-[GAED]-x(2)-[STAVR]-x-[LIV]-[GAED]-x(2)-[STAV]-x-[LIV]-x(3)-[LIV]  специфична  1
PS00008 MYRISTYL Сайт N-миристоилирования паттерн G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} неспецифична 7
 PS00005  PKC_PHOSPHO_SITE  Cайт фосфорилирования протеинкиназы C (Protein kinase C phosphorylation site)  паттерн  [ST]-x-[RK]  неспецифична  2
 PS00007  TYR_PHOSPHO_SITE  Сайт фосфорилирования тирозинкиназы (Tyrosine kinase phosphorylation site)  паттерн  [RK]-x(2)-[DE]-x(3)-Y или [RK]-x(3)-[DE]-x(2)-Y  неспецифична  1
 PS00006  CK2_PHOSPHO_SITE  Сайт фосфорилирования казеинкиназы II (Casein kinase II phosphorylation site)  паттерн  [ST]-x(2)-[DE] [S or T is the phosphorylation site]  неспецифична  4
 PS00001  ASN_GLYCOSYLATION  Сайт N-гликозилирования (N-glycosylation site)  паттерн  N-{P}-[ST]-{P}  неспецифична  1


©Nechay Olesya 2005