########################################
# Program: needle
# Rundate: Thu Sep 28 2006 18:03:13
# Commandline: needle
# [-asequence] glmu_gene3.fasta
# [-bsequence] glmu_gene2.fasta
# [-outfile] gene3-gene2.needle
# -auto
# Align_format: srspair
# Report_file: gene3-gene2.needle
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: L10328
# 2: X01631
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1372
# Identity: 1369/1372 (99.8%)
# Similarity: 1371/1372 (99.9%)
# Gaps: 1/1372 ( 0.1%)
# Score: 6837.0
#
#
#=======================================
L10328 1 atgttgaataatgctatgagcgtagtgatccttgccgcaggcaaaggcac 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 1 atgttgaataatgctatgagcgtagtgatccttgccgcaggcaaaggcac 50
L10328 51 gcgcatgtattccgatcttccgaaagtgctgcatacccttgccgggaaag 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 51 gcgcatgtattccgatcttccgaaagtgctgcatacccttgccgggaaag 100
L10328 101 cgatggttcagcatgtcattgatgctgcgaatgaattaggcgcagcgcac 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 101 cgatggttcagcatgtcattgatgctgcgaatgaattaggcgcagcgcac 150
L10328 151 gttcacctggtgtacggtcacggcggcgatctgctaaaacaggcgctgaa 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 151 gttcacctggtgtacggtcacggcggcgatctgctaaaacaggcgctgaa 200
L10328 201 agacgacaaccttaactgggtgcttcaggcagagcagctgggtacgggtc 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 201 agacgacaaccttaactgggtgcttcaggcagagcagctgggtacgggtc 250
L10328 251 atgcaatgcagcaggccgcacctttctttgccgatgatgaagacatttta 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 251 atgcaatgcagcaggccgcacctttctttgccgatgatgaagacatttta 300
L10328 301 atgctctacggcgacgtgccgctgatctctgtcgaaacactccagcgtct 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 301 atgctctacggcgacgtgccgctgatctctgtcgaaacactccagcgtct 350
L10328 351 gcgtgatgctaaaccgcagggtggcattggtctgctgacggtgaaactgg 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 351 gcgtgatgctaaaccgcagggtggcattggtctgctgacggtgaaactgg 400
L10328 401 atgatccgaccggttatggacgtatcacccgtgaaaacggcaaagttacc 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 401 atgatccgaccggttatggacgtatcacccgtgaaaacggcaaagttacc 450
L10328 451 ggcattgttgagcacaaagatgccaccgacgagcagcgtcagattcagga 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 451 ggcattgttgagcacaaagatgccaccgacgagcagcgtcagattcagga 500
L10328 501 gatcaacaccggcattctgattgccaacggcgcaggatatgaaacgctgg 550
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
X01631 501 gatcaacaccggcattctgattgccaacggcgca-gatatgaaacgctgg 549
L10328 551 ctggcgaasstgaccaacaataatgctcagggcgaatactacatcaccga 600
||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 550 ctggcgaacgtgaccaacaataatgctcagggcgaatactacatcaccga 599
L10328 601 cattattgcgctggcgtatcaggaagggcgtgaaatcgtcgccgttcatc 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 600 cattattgcgctggcgtatcaggaagggcgtgaaatcgtcgccgttcatc 649
L10328 651 cgcaacgtttaagcgaagtagaaggcgtgaataaccgcctgcaactctcc 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 650 cgcaacgtttaagcgaagtagaaggcgtgaataaccgcctgcaactctcc 699
L10328 701 cgtctggagcgtgtttatcagtccgaacaggctgaaaaactgctgttagc 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 700 cgtctggagcgtgtttatcagtccgaacaggctgaaaaactgctgttagc 749
L10328 751 aggcgttatgctgcgcgatccagcgcgttttgatctgcgtggtacgctaa 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 750 aggcgttatgctgcgcgatccagcgcgttttgatctgcgtggtacgctaa 799
L10328 801 ctcacgggcgcgatgttgaaattgatactaacgttatcatcgagggcaac 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 800 ctcacgggcgcgatgttgaaattgatactaacgttatcatcgagggcaac 849
L10328 851 gtgactctcggtcatcgcgtgaaaattggcaccggttgcgtgattaaaaa 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 850 gtgactctcggtcatcgcgtgaaaattggcaccggttgcgtgattaaaaa 899
L10328 901 cagcgtgattggcgatgattgcgaaatcagtccgtataccgttgtggaag 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 900 cagcgtgattggcgatgattgcgaaatcagtccgtataccgttgtggaag 949
L10328 951 atgcgaatctggcagcggcctgtaccattggcccgtttgcccgtttgcgt 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 950 atgcgaatctggcagcggcctgtaccattggcccgtttgcccgtttgcgt 999
L10328 1001 cctggtgctgagttgctggaaggtgctcacgtcggtaacttcgttgagat 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 1000 cctggtgctgagttgctggaaggtgctcacgtcggtaacttcgttgagat 1049
L10328 1051 gaaaaaagcgcgtctgggtaaaggctcgaaagctggtcatctgacttacc 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 1050 gaaaaaagcgcgtctgggtaaaggctcgaaagctggtcatctgacttacc 1099
L10328 1101 tgggcgatgcggaaattggcgataacgttaacatcggcgcgggaaccatt 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 1100 tgggcgatgcggaaattggcgataacgttaacatcggcgcgggaaccatt 1149
L10328 1151 acctgcaactacgatggtgcgaataaatttaagaccattatcggcgacga 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 1150 acctgcaactacgatggtgcgaataaatttaagaccattatcggcgacga 1199
L10328 1201 tgtgtttgttggttccgacactcagctggtggccccggtaacagtaggca 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 1200 tgtgtttgttggttccgacactcagctggtggccccggtaacagtaggca 1249
L10328 1251 aaggcgcgaccattgctgcgggtacaactgtgacgcgtaatgtcggcgaa 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 1250 aaggcgcgaccattgctgcgggtacaactgtgacgcgtaatgtcggcgaa 1299
L10328 1301 aatgcattagctatcagccgtgtgccgcagactcagaaagaaggctggcg 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
X01631 1300 aatgcattagctatcagccgtgtgccgcagactcagaaagaaggctggcg 1349
L10328 1351 tcgtccggtaaagaaaaagtga 1372
||||||||||||||||||||||
X01631 1350 tcgtccggtaaagaaaaagtga 1371
#---------------------------------------
#---------------------------------------