Что такое филогенетическое дерево?
Отобранные бактерии
Из списка бактерий отдела Firmicutes выбрали 7 видов, для которых приведены полное латинское и краткое название.
| Название | Мнемоника |
| Ваcillus subtilis | BACSU |
| Clostridium botulinum | CLOB1 |
| Enterococcus faecalis | ENTFA |
| Geobacillus kaustophilus | GEOKA |
| Lactobacillus delbrueckii | LACDA |
| Listeria monocytogenes | LISMO |
| Streptococcus pyogenes | STRP1 |
C использованием приведенного филогенетического дерева построили дерево для выбранных бактерий.Запишем скобочную форму:
(CLOB1, ((LACDA, (ENTFA,STRP1)), (LISMO,(BASCU, GEOKA))))
C помощью программы MEGA получили изображение искомого дерева:
 |
Рис.1 Графическое изображение построенного дерева |
В данном дереве из 7 листьев присутствуют 4 нетривиальных ветви(те, что делят дерево на подмножество листьев, в каждом из которых содержится более одного элемента.
1){BACSU,GEOKA}vs{LISMO,SPTR1,ENTFA,LACDA,CLOB1}2){BACSU,GEOKA,LISMO}vs{STRP1,ENTFA,LACDA,CLOB1}
3){BACSU,GEOKA,LISMO,LACDA,CLOB1}vs{ENTFA,STRP1}
4){BACSU,GEOKA,LISMO,CLOB1}vs{STRP1,ENTFA,LACDA}
© Boskhomdzhieva Baina, 2014