Гомология и выравнивание

Выбор ID семейства белковых доменов из базы Pfam

ID: YbeY
AC: PF02130
Summary name: Endoribonuclease YbeY

Описание выравнивания белковых доменов с точки зрения гомологичности всех последовательностей или их подмножества

Ссылка на проект Jalview

Информация комментарии
Выравнивание seed 180 последовательностей
236 колонок
Максимальный достоверный блок,
включающие ВСЕ последовательности (МДБ-all)
202-207
100% консервативные колонки в  МДБ-all 202:H
206:H
Максимальный достоверный блок,
включающий НЕ ВСЕ последовательности. (МДБ-notAll)
Если есть другие максимальные блоки
с тем же подмножеством последовательностей, то опишите их.
Позиции: 138-233
Последовательности: 1-16
100% консервативные колонки в  МДБ-notAll 143:G
144:E
148:L
149:G
150: D
151:I
154:S
161:Q
162:A
171:H
180:R
181:E
198:F
199:L
202:H
203:S
204:M
205:L
206:H
207:L
209:G
210:Y
211:D
212:H
213:M
225:M
226:E
229:Q
Указала только про
100% консервативные колонки,
т.к. если расписывать еще и про
функциональные колонки — получится
очень много, а информативности
больше не будет.
Участок выравнивания,
в котором нет никаких достоверных подблоков,
и потому маловероятно,
что выравнивание на этом участке отражает ход эволюции.
84-147