С использованием Pymol рассмотрим структуре белка 3HZB подробнее.
В асимметрическую единицу входит 8 белковых цепей, а в биологическую единицу — 2 цепи. На рис1 изображен белок, где разными цветами покрашены разные цепи, и выделена одна биологическая единица (цепи A и B).
При покраске белка по типу вторичной структуры (рис 2), видно, что в большем количестве представлены белковые тяжи.
Из малых молекул, помимо воды, в записи присутствуют ионы кальция. На рис3 показаны аминокислотные остатки белка на расстоянии до 5 ангстрем от молекулы лиганда.
