Гистидил т-РНК синтетаза(histidyl-tRNA synthetase)

Oписание общих характеристик белка по данным отчета за первый блок:

  • Краткое название белка: SYH_ECOLI
  • Полное название организма: Escherichia coli. K-12
  • Название гена: hisS
  • Номер локуса в бактериальной хромосоме: b2514
  • Последовательность в формате FASTA:
     MAKNIQAIRGMNDYLPGETAIWQRIEGTLKNVLGSYGYSEIRLPIVEQTPLFKRAIGEVTDVVEKEMYTFEDRNGDSLTLRPEGT
     AGCVRAGIEHGLLYNQEQRLWYIGPMFRHERPQKGRYRQFHQLGCEVFGLQGPDIDAELIMLTARWWRALGISEHVTLELNSIGS
     LEARANYRDALVAFLEQHKEKLDEDCKRRMYTNPLRVLDSKNPEVQALLNDAPALGDYLDEESREHFAGLCKLLESAGIAYTVNQ
     RLVRGLDYYNRTVFEWVTNSLGSQGTVCAGGRYDGLVEQLGGRATPAVGFAMGLERLVLLVQAVNPEFKADPVVDIYLVASGADT
     QSAAMALAERLRDELPGVKLMTNHGGGNFKKQFARADKWGARVAVVLGESEVANGTAVVKDLRSGEQTAVAQDSVAAHLRTLLG

    Мои вычисления с помощью Excel:

    Аминокислотный состав
    А(Аланин) 9,67%
    C(Цистеин) 1,18%
    D(Аспарагиновая кислота) 5,19%
    E(Глутаминовая кислота) 8,02%
    F(Фенилаланин) 2,83%
    G(Глицин) 9,67%
    H(Гистидин) 1,89%
    I(Изолейцин) 3,54%
    K(Лизин) 3,77%
    L(Лейцин) 11,56%
    M(Метионин) 2,12%
    N(Аспарагин) 4,01%
    P(Пролин ) 3,3%
    Q(Глутамин) 4,48%
    R(Аргинин) 7,55%
    S(Серин) 3,77%
    T(Треонин ) 4,72%
    V(Валин) 7,78%
    W(Триптофан) 1,415%
    Y(Тирозин) 3,54%
    Длина последовательности: (в а.о.) 424
    Молярная масса белка: 47035,36 г/моль
    Средний электрический заряд белка:
    cр.зар. при рН=1,0 cр.зар. при рН=7,0 cр.зар. при рН=8,0
    85,34e -7,13e -9,8e
    Относительное содержание гидрофобных и гидрофильных аминокислотных остатков в моём белке = 1,протеоме Escherichia coli K-12 =1,10 и в транспортных белках класса ТС.2.А. = 7,37056928 Рассматривая cреднее содержание аминокислот в протеоме E.coli и бактериальных транспортерах класса TC.2A, пришёл к выводу, что отношение в протеоме почти = 1,1, а в бактериальных транспортерах класса TC.2A сильно отлично от 1 (частота гидрофобных аминокислот значительно больше гидрофильных; всё это указывает на мембранный белок, большая часть которого расположена в билипидном слое).

    На главную страницу семестра


    ©Ларионов Дмитрий