Мотивы в белке Гистидил тРНК синтетаза (ID=SYH_ECOLI, AC=P60906), описанные в БД Prosite

Задание: найти в последовательности моего белка все мотивы, описанные в PROSITE, в том числе неспецифичные (часто встречающиеся). По результатам поиска составить таблицу:

Идентификатор документа PROSITE (AC) Название мотива Краткое описание мотива Тип подписи (паттерн, профиль, правило) Паттерн (регулярное выражение) Специфична ли подпись? Сколько мотивов нашлось в белке?
PS00001 ASN_GLYCOSYLATION сайт N-гликозилирования паттерн N - {P} - [ST] - {P} неспецифична 2
PS00006 CK2_PHOSPHO_SITE сайт фосфорилирования казеинкиназы II паттерн [ST]-x(2)-[DE] неспецифична 3
PS00008 MYRISTYL сайт N-миристоилирования паттерн G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} неспецифична 10
PS00005 PKC_PHOSPHO_SITE сайт фосфорилирования протеинкиназы C паттерн [ST]-x-[RK] неспецифична 3
PS00003 SULFATION сайт сульфатирования тирозина правило *правило описано ниже
    неспецифична 1
    PS50862 AA_TRNA_LIGASE_II признак (подпись) белков семейства аминоацил тРНК синтетаз класса II домен см. здесь, а также на cтраничке специфична 1

    На главную


    ©Ларионов Дмитрий 2005