Занятие 8
Задание 1
Фермент: ACADS_HUMAN
KEGG ID: hsa:35
Метаболические пути:
Pathway
hsa00071 Fatty acid metabolism - метаболизм жирных кислот
hsa00280 Valine, leucine and isoleucine degradation - расщепление валина, лейцина и изолейцина
hsa00650 Butanoate metabolism - метаболизм бутанона
hsa01100 Metabolic pathways - общая карта метаболических путей
Задание 2
Лиганды, их ID и стр. формулы:
хоризмат (chorismate)C00251
убихинон (ubiquione, coenzyme Q)C00399
Задание 3
Карта:
Убихиноновые и другие терпеноид-хиноновые биосиинтезы
Хоризмат ↔ 4-гидроксибензоат → 2-полипренилфенол → 2-полипренил-6-гидроксифенол
→ 2-полипренил-6-метоксифенол → 2-полипренил-6-метокси-1,4-бензохинон → 2-полипренил-3-метил-6-метокси-1,4-бензохинон
→ 2-полипренил-3-метил-5-гидрокси-6-метокси-1,4-бензохинон → Убихинон-н
(На 4-гидроксибензоате происходит раздвоение пути, вновь соединяется на 2-полипренил-6-метоксифеноле).
Путь
Возможность выбранной цепочки ферментативных реакций в разных
организмах
| Организм |
Цепочка реакций возможна
(да/нет/неизвестно) |
Обоснование |
| Bacillus subtilis |
да |
есть все ферменты для синтеза |
| Archaeoglobus fulgidus |
да |
есть все ферменты для синтеза |
| Arabidopsis thaliana |
да |
есть все ферменты для синтеза |
| Homo sapiens |
да |
есть все ферменты для синтеза |
Коэнзим Q - очень важный фермент, участвующий в окислительном фофорилировании,хоризмат - центральный фермент в синтезе хинонов,
поэтому такая распространенность данной цепочки вполне понятна.