Задание 1. Таксономия отобранных бактерий
|
Bordetella pertussis |
Burkholderia cenocepacia |
Haemophilus influenzae |
Neisseria meningitidis |
Polynucleobacter asymbioticus |
Proteus mirabilis |
Saccharophagus degradans |
Yersinia pestis |
| Mnemonics |
BORPE |
BURCA |
HAEIN |
NEIMA |
POLAQ |
PROMH |
SACD2 |
YERPE |
| - |
Cellular organisms |
Cellular organisms |
Cellular organisms |
Cellular organisms |
Cellular organisms |
Cellular organisms |
Cellular organisms |
Cellular organisms |
| Superkingdom |
Bacteria |
Bacteria |
Bacteria |
Bacteria |
Bacteria |
Bacteria |
Bacteria |
Bacteria |
| Phylum |
Proteobacteria |
Proteobacteria |
Proteobacteria |
Proteobacteria |
Proteobacteria |
Proteobacteria |
Proteobacteria |
Proteobacteria |
| Class |
Betaproteobacteria |
Betaproteobacteria |
Gammaproteobacteria |
Betaproteobacteria |
Betaproteobacteria |
Gammaproteobacteria |
Gammaproteobacteria |
Gammaproteobacteria |
| Order |
Burkholderiales |
Burkholderiales |
Pasteurellales |
Neisseriales |
Burkholderiales |
Enterobacterales |
Cellvibrionales |
Enterobacterales |
| Family |
Alcaligenaceae |
Burkholderiaceae |
Pasteurellaceae |
Neisseriaceae |
Burkholderiaceae |
Morganellaceae |
Cellvibrionaceae |
Yersiniaceae |
| Genus |
Bordetella |
Burkholderia |
Haemophilus |
Neisseria |
Polynucleobacter |
Proteus |
Saccharophagus |
Yersinia |
Нетривиальная ветвь 3 (см. предыдущий практикум) выделяет таксон Class (Betaproteobacteria и Gammaproteobacteria). 4 ветвь выделяет порядок (Order) Burkholderiales, 1 нетривиальная ветвь выделяет порядок Enterobacteriales. Нетривиальная ветвь 5 выделяет семейство (Family) Burkholderiales
Выбранный белок:
Энолаза ENO
Методы:
Maximum Liklihood
Neighbor-Joining
Minimum Evolution
UPGMA
Maximum Parsimony