Задание 4

C помощью локального BLAST (blastp) была полчена группа белков, гомологичных
нашему запросу - CLPX_ECOLI (ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX )
В результате чего был получен общий файл с последовательностями и файл с выравниванием
(построено с помощью MUSCLE)
Полученный файл был загружен в программу MEGA, где производилось построение дерева с помощью алгоритма Maximum Likelihood (ML)




Оттенками зеленого отмечены ортологи - CLPX и HSLU (ATP-dependent protease ATPase subunit HslU;
субъединица (шаперон-?) входящая в состав той же АТФ-зависимой протеазы)
Синим отмечены паралоги NEIMA, голубым - паралоги YERPE