Описание бациллолизина из генома бактерии Bacillus cereus sp. A1

>ANE88985.1 bacillolysin
MKKKSLALVLATGMAVTTFGGTGSAFADSKNVLSTKKYNETVQS
PEFISGDLTGATGKKAESVVFDYLNAAKGDYKLGEKSAQDSFKVKQVKKDAVTDSTVV
RMQQVYEGVPVWGSTQVAHVSKDGSLKVLSGTVAPDLDKKEKLKNKNKIEGAKAIEIA
QQDLGVTPKYEVEPKADLYVYQNGEETTYAYVVNLNFLDPSPGNYYYFIEADSGKVLN
KYNKLDHVTNEDKSPVKQEAPKQDAKAVVKPVTGTNKVGTGKGVLGDTKSLNTTLSGS
SYYLQDNTRGATIFTYDAKNRTTLPGTLWVDADNVFNAAYDAAAVDAHYYAGRTYDYY
KATFNRNSINDAGAPLKSTVHYGSKYNNAFWNGSQMVYGDGDGVTFTSLSGGIDVIGH
ELTHAVTENSSDLIYQNESGALNEAISDIFGTLVEFYDNRNPDWEIGEDIYTPGKAGD
ALRSMSDPAKYGDPDHYSKRYTGTSDNGGVHTNSGIINKQAYLLANGGTHSGVTVTGI
GKDKLGAIYYRANTQYFTQSTTFSQARAGAVQAAADLYGATSAEVAAVKQSFSAVGIN

Таблица 1. Описание белка бациллолизина из генома бактерии Bacillus cereus sp. A1

Индентификатор белка ANE88985.1
Индентификатор генома CP01572.1
Название белка Bacillolysin
Координаты гена в геноме 5284201..5285901
Длина гена 1701
Цепь (вид) прямая
Длина белка(aa) 566

Геномное окружение гена изучаемого белка

альтернативный текст

Рисунок 1. Геномное окружение гена белка бациллолизина (индентификатор белка ANE88985.1) Изображение получено с помощью геномного браузера NCBI.

Самая верхняя строка с цифрами и перегородками указывает на семь рамок считывания данного участка генома. Зеленым отмечены старт-кодоны, красным – стоп-кодоны. Серые прямоугольники обозначают открытые рамки считывания."+2/3" - обозначает рамку, сдвинутую на указанное количество пар оснований относительно начала генома. Белыми стрелками обозначено направление транскрипции с комлементарной цепи и трансляции с иРНК (то же самое обозначено черными стрелками на рамках считывания сверху) Ниже красным цветом схематично выделены исследуемый ген (по уентру) и окружающие его гены (ANE88986.1). .
© Бердникович Екатерина, 2017