Sugar binding protein

  • Applet
  • Table 1. Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре.
    # Имена атомов Длина связи (A°) N-O-C угол (°)
    Альфа спирали
    1 N(181CYS)-O(177ALA) 3.05 154.3
    2 N(183LEU)-O(179ASN) 3.07 159.5
    3 N(182ARG)-O(178ASP) 3.19 150.9
    Среднее значение 3.10 154.9
    Бета тяжи
    1 N(264ASN)-O(256HIS) 3.04 163.5
    2 N(215ASP)-O(264ASN) 2.85 148.5
    3 N(266ASP)-O(254CYS) 2.8 153.3
    Среднее значение 2.89 155.1

    Из таблицы делаем вывод, что значения длины водородных связей колеблются от 2.8 до 3.19 ангстрем. Причём мы видим: в бета тяжах связи короче, чем в альфа спиралях (по среднему значению из трех)). А значение углов N-O-C находятся между 150.9 и 163.5 градусами. Но средние значения углов в альфа спиралях и бета тяжах почти совпадают.

  • Список литературы
  • Учебный сайт

    PDB банк


    © Бердникович Екатерина, 2017