BLAST

1. Характеристики списка находок

Всего находок

37

Количество находок с E-value менее одной тысячной

36

Максимальное E-value находки

5,8

Список лимитирован E-value, тк находок всего 37 шт, а по умолчанию в (Algorithm parameters) --> (Max target sequences) стоит 50,

если поставить ограничение на 10, то список будет лимитирован максимальным числом находок и E-value при нем будет 0.0

2. Изменение длины слова

Всего находок 39

Количество находок с E-value менее одной тысячной 36

Максимальное E-value находок 5,8

3. Изменение объёма поиска

Без ограничения на таксон

ID: P83543.2

E-value: 5,00E-50

Organizm: Streptomyces mobaraensis (Streptoverticillium mobaraense)

Taxonomy: Bacteria; Actinobacteria; Streptomycetales; Streptomycetaceae;Streptomyces

С ограничением поиска на Actinobacteria (id:201174)

E-value: 2,00E-51

Вывод: Из всех последовательностей, которые мы нашли без ограничения на таксон

(39) оказалось 7 белков, выделенных из родственных организмов (актинобактерий).

Вес не изменился как в битах, так и обычный. 187 bits(475) в обоих случаях. Вне зависимости от количества (или же других параметров находок),

вес - характеристика отдельного выравнивания. Он не должен меняться от ограничения списка остальных выравниваний.