Банк UniProt

Таблица с данными о белке.

Таблица 1. Представлена 4 цепями в записях PDB. Вторичная структура известна для всего белка

UniProt AC P50384
UniProt ID TRPD_SULSO
Рекомендуемое UniProt название Full=Anthranilate phosphoribosyltransferase {ECO:0000255|HAMAP-Rule:MF_00211}
RefSeq WP_009992305.1
PDB ID 1GXB; 1O17; 1ZXY; 1ZYK; 2GVQ; 3GBR;
Длина в аминокислотных остатках 345 AA
Молекулярная масса в дальтонах 37574 MW

Описание кластеров UniRef для Anthranilate phosphoribosyltransferase protein.

UniRef50_P50384: 24(26) proteins in cluster

UniRef90_P50384: 12(14) proteins in cluster

UniRef100_P50384: 2(3) proteins in cluster

(P.s. a(b) proteins in cluster. Если войти в "full view", будет в таблице (a) строчек (нужное нам число). Но если посмотреть колонку "size", то в ней будет число (b). Что, по-идее, должно указывать на кол-во строк (размер) таблицы.

Length of sequence: 345

Cluster name: Anthranilate phosphoribosyltransferase

Результаты сеансов поиска в UniProt.

  • Full name

    • Запрос: name:"anthranilate phosphoribosyltransferase"

    Кол-во белков: 20,072

    Кол-во из раздела Reviewed (т.е. Swiss-Prot): 573

    Др моменты:

    Запрос: name:"anthranilate phosphoribosyltransferase" AND organism:"Homo sapiens (Human) [9606]»

    Кол-во белков: 20,072

  • Name and organism

    • Запрос: name:"anthranilate phosphoribosyltransferase" organism:"sulfolobus solfataricus strain atcc 35092"

    Кол-во белков: 1

    Кол-во из раздела Reviewed (т.е. Swiss-Prot): 1

  • Name and family

    Запрос: name:"anthranilate phosphoribosyltransferase" taxonomy:sulfolobaceae

    Кол-во белков: 27

    Кол-во из раздела Reviewed (т.е. Swiss-Prot): 17

  • Name and phylum

    • Запрос: name:"anthranilate phosphoribosyltransferase" taxonomy:crenarchaeota

    Кол-во белков: 68

    Кол-во из раздела Reviewed (т.е. Swiss-Prot): 17

    Др моменты:

  • Protein type

    • Запрос: name:homeobox

    Кол-во белков: 44, 012

    Кол-во из раздела Reviewed (т.е. Swiss-Prot): 1 396

  • Protein type and group

    • Запрос: name:homeobox taxonomy:viridiplantae

    Кол-во белков: 7,363

    Кол-во из раздела Reviewed (т.е. Swiss-Prot): 225

    Запрос: name:homeobox taxonomy:fungi

    Кол-во белков: 1,357

    Кол-во из раздела Reviewed (т.е. Swiss-Prot): 18

    Др моменты: max length: 2,322; min length: 29

  • Trypsin
    • Запрос: name:trypsin

    Кол-во белков: 18,951

    Кол-во из раздела Reviewed (т.е. Swiss-Prot): 311

  • Trypsin and function

    • Запрос: name:trypsin annotation:(type:function inhibitor)

    Кол-во белков: 71

    Кол-во из раздела Reviewed (т.е. Swiss-Prot): 71

    © Бердникович Екатерина, 2017