1. Работа с KEGG PATHWAY

Общие сведения о метаболическом пути эфира липидов.

map00565

для чего он нужен организмам Они входят в структуру клеточных мембран и участвуют в транспорте жира в организме. Вещества: Начальные 1-ацил-глицерон-3-фосфат Конечные - sn-глицеро-3-фосфохолин.

По данным базы KEGG метаболический путь связан с путем метаболиза холина в раке (map05231) через вещество sn-Glycero-3-phosphocholine(синяя рамка-конечное соединение) К тому же путь эфира липидов связан с Neuroactive ligand-receptor interaction и Астмой через 2-Acetyl-1-alkyl-sn-glycero-3-phosphocholine(розовая рамочка)

Метаболический путь эфира липидов в разных доменах жизни

Организмы: бактерия-Salmonella enterica subsp. enterica serovar Tennessee(класс Gammaproteobacteria, филум Proteobacteria) архея-Candidatus Methanomassiliicoccus intestinalis Issoire-Mx1 (класс- Thermoplasmata филум- Euryarchaeota)(для архей нет метаболического пути эфира липидов) эукариота-Odobenus rosmarus divergens (Pacific walrus)(тихоокеанский морж)(класс-Mammalia; филум-Chordata;)

Salmonella enterica

Pacific walrus

Пояснения:

Раз такой карты не составлено для архей, значит данных ферментов как и пути нет у архей. Что касается Эукариот, то у тихоокеанского моржа присутствуют почти все ферменты ответственные за данный метаболический путь(присутствующие отмечены зеленым), к тому же у Моржа эти ферменты образуют цепочки из реакций. От начальных веществ к конечным не ведут, но не трудно заметить что от начальных к конечным веществам не хватает всего пяти ферментов. По тоу, что у органихма достаточно ферментов чтобы осуществлять большинство превращений, можно сделать вывод, что морж способен к такому метаболическому пути.

Что касается бакерий, то у них присутствуют всего два фермента из данного метаболического пути. Вероятнее всего эти ферменты выполняют другие функции и данного пути вообще в бактериях не наблюдается.

2. Работа с KEGG REACTION

Реакция окисления 1-Алкил-sn-глицеро-3-фосфата в базе данных KEGG

R04360

Реакция в метаболическом пути эфира липида помечена зеленой рамочкой.

E-mail: Задавайте вопросы по электронной почте


© Бердникович Екатерина, 2017