Второй семестр |
|||||||
Продолжение начала |
Главная |
Семестры |
Ссылки |
О себе |
|||
B данном праке работа будет сделана с помощью PsiBLAST - Position Specific Interated BLAST. Главная его цель - поиск гомологов, основываясь на профиле, построенном по уже найденным гомологам. Таким образом, он даёт возможность найти далеких гомологов. Это программа может искать в разных базах данных, я выбрала "Non-redndant protein sequences" член 13с суперсемейства рецепторных факторов некроза опухолиЯ выбрала последовательность белка Q3SXS7. Это белок является рецептором фактора некроза опухоли .
В результате каждой интерация получается два окна: с хорошими последовательностями и с плохими последовательностями. Отражение результатов каждой интерации см в таблице1. После 5 интерации мне не удалось стабилизировать результат. Ниже представлена ссылка на множественное выравнивание. Проэкт |