Второй семестр

Продолжение начала

Главная

Семестры

Ссылки

О себе

В данном практикуме мы будем работать с поисковой системой Uniprot. Идентификатор белка в этой система Uniprot Q8DIR2.(идентификатор в RefSeq NP_682309.1)

Чтобы найти ортологи, я ввела в поиск запись: taxonomy:"Thermosynechococcus [146785]" AND name:"Superoxide dismutase". Было найдено 4 записи.Результаты в таблице. Чтобы получить эти данные я использовала такие запосы:

  • entret uniprot:ID
  • less filename
  • grep ^CODE filename

    • Таблица

    Три вопроса:

  • Какие участки белка (напишите номера аминокислотных остатков) участвуют в связывании лиганда? Какого?

    • Лиганд FE связан с аминокислотами №28,80,162,166

  • Какие ионы связываются с белком?

    • Связываются ионы Fe

  • Опишите функцию и состав комплекса, в который входит данный белок?

    • Избавляется от токсичных радикалов в клектке.Белок не входит в состав комплекса, он является самодостаточным