В биоинформатике для изучения разных белков существуют разные программы. Одна из этих программ это Jmol. Мне был дан белок с индефекатором 1YM6 в базе RBD. Это белок супероксидисмутаза из термофильной цианобактерии. ЕЕ пространственная структура изображена на рис1. Ссылка на скрипт, с помощью которого можно сделать это изображение
Рис1. Изображение белка
На моем рисунке альфа-спирали изоражены празными цветами(оттенки фиолетового). Каждый вета-тяж изображен по-разному. Для одного используется окраска стандартными цветами в зависимости от атома: углерод - серый, азот - синий, кислород - красный, водород - бесцветный(cpk) В другом четко выделен остов белка. В третьем я показала боковые цепи. В моем белке есть есть 2 цепи:A и B,также есть лиганд Fe.Также в таблице(см нижк) указана информация о белке
|
