Четвертый семестр

Интересно и полезно

Главная

Семестры

Ссылки

О себе

Укоренение и бутстрэп

Цель данной задачи - укоренить дерево в среднюю точку.

За исходное мы взяли дерево, построенные при выполнении прошлого задания (методом Neighbor-Joining using % identity).(Рис.1)

Дерево реконструированиое методом "Neighbor Joining Using % Identity".

Далее поскольку программа MEGA не укореняет деревья, построенные в JalView, восполизь программой retree пакета PHYLIP. С помощью это й программы мы укоренили дерево в среднюю точку.(Рис.2)

Дерево, укорененное в среднюю точку.

Дерево укоренилось в ветвь {ENTFA,LACLM} vs {STRP1,STRPN,STAA1,STAES,LISMO}, что не совпадает с исходным деревом из предыдущего практикума. Следовательно, это укоренение нельзя считать достоверным.