Седьмой семестр
	Интересно и полезно		Главная	Семестры	Ссылки	О себе

Построение и визуализация электронной плотности (ЭП) Электронная плотность белка Для исследования был выбран транспортный белок RanGDP с разрешением - 1.82 А.(PDB - 3GJ0) Данный белок учавствует в транспорте молекул через ядерную пору. В следствие того, что данный процесс энергоемкий, для прохождение через пору RAN-белок использует энергию расщепления GTF. Также пара GTF/GDF используется для регуляции этго процесса. Статья, описывающую данную структуру, доступна по данной ссылки. Характеристики белок: имеет две цепи(A и B); Длина 221 аминокислота; Разрешение - 1.48 A; R-Value Free - 0.203; R-Value Work - 0.180; Была построена визуализация электронной плотности вокруг полипептиднй цепи без боковых остатков. Данное изображение представленно ниже на Рис.1. Рис.1. Визуализация электронной плотности вокруг остова белковой цепи. Изображение ЭП вокруг нескольких боковых радикалов полипептидной цепи Были выбраны три аминокислоты цепи В: Аргинин (76), Тирозин (79), Глутаминовая кислота (34). На рисунках, представленных ниже, показаны результаты для трёх уровней подрезки 0.5,1 и 1.5 (справва налево) Рис.2a. Визуализация электронной плотности вокруг остатка Тирозина(79) Рис.2b. Визуализация электронной плотности вокруг остатка Глутаминовой кислоты(34) Рис.2c. Визуализация электронной плотности вокруг остатка Аргинина(76) Заключение По ранее представленным рисункам, можно утверждать, что данная структура определена в целом в соответствии с полученной в результате эксперемента электронной плотностью.