Седьмой семестр
	Интересно и полезно		Главная	Семестры	Ссылки	О себе

Построение поверхности Для комплекса димера пуринового репрессора с ДНК (PDB ID 1VPW) было создаys разные изображения взаимодействий между частями белка(см. ниже). Как видно из рисунков, Днк и белок образуют прочные связи., так как площадь поверхности взаимодействия большая. Рис.1 Изображение поверхности контакта мономера белка с симметричным мономером на фоне остовной (ribbon) модели мономера Рис.2 Поверхность контакта димера белков с двойной спиралью ДНК на фоне остовной модели части белка, вовлечённой в контакт Рис.3 Поверхности контакта ДНК с димером белков на фоне проволочной (sticks) модели двойной спирали. Из ниже представленного рисунка можно сделать вывод, что гидрофобные связи активно учавствуют в образовании димера данного белка. Рис.4 Поверхность, относящаяся к атомам, входящим в найденные гидрофобные кластеры, выделена цветом(поверхности выделены Не светлоголубым цветом).