Гидрофобные кластерыГидрофобные кластеры в структуре белка 3gj8Данный комплекс состоит из двух белков Ran-GDP(транспортного белка) и Nup-153(белка ядерной поры). Параметры: Distance threshold - 4.7; Show clusters not smaller than 10 atoms. На Рис.1 показано данное разбиение. Четко видно разбиение по цепям. А розовый и темнокрасный кластер указывает на гидрофобное взаимодействие между доменами. 
Рис.1 Гидрофобные кластеры белка 3gj8 Найдите гидрофобные кластеры на интерфейсе двух цепочек в структуре белка 4OWFДанный белок участвует в транскрипции и является свящывающий доменов. На Рис.2 предстален гидрофобные кластеры, образованные двумя альфа-спиралями. 
Рис.2 Гиброфобный кластер двух альфа-спиралей |