BLAST

1,2. Характеристики списка находок

Длина слова 6 2
Всего находок 100 263
Находок с E-value < 0,001 100 148
Максимальное E-value 8e-24 10

Список находок был лимитирован максимальным числом находок.

При увеличении максимального числа находок до 500 было найдено 118 находок с максимальным E-value = 4,9.

3. Изменение объёма поиска

Выбранный таксон: Rhizobium leguminosarum (taxid:384) (Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Rhizobiaceae; Rhizobium/Agrobacterium group; Rhizobium.)

E-value = 4e-120

E-value "ограниченного" поиска = 6e-123

E-value "ограниченного" поиска уменьшился, так как уменьшились размеры банка, из которого взяты последовательности. Вес выравнивания не изменился, так как не зависит от размеров банка.