Ссылка на выравнивание выравниваний:
Ссылка на проект JalViewВыравнивание глобальное (needle) и локальное (water) не имеют различий, кроме того, что локальное короче. У глобального с множественным (muscle) есть различия:
Muscle: R(27) - Q(26) Needle: R(27) - gap
Muscle: Q(28) - D(27) Needle: Q(28) - Q(26)
Muscle: D(29) - S(28) Needle: D(29) - D(27)
Muscle: E(30) - gap Needle: E(30) - S(28)
Более правдоподобным считаю глобальное (needle) выравнивание, так как глобальное выравнивание сделало более верное соответствие аминокислотных остатков, чем множественное.