Занятие 14: Контакты в структуре белка

Примеры разных контактов в молекуле белка GLVA_BACSU

1.Пример гидрофобного контакта

Для примера гидрофобного взаимодействия был рассмотрен 203 остаток фенилаланина, имеющий наибольшее количество гидрофобных контактов.

2.Примеры водородной связи между боковыми группами

Водородная связь между гидроксилом тирозина (донор) и карбонилом пролина (акцептор) Расстояние 2,58A
Водородная связь между побочной аминогруппой аспарагина (донор) и азотом аргинина, участвующим в образовании пептидной связи (акцептор).
Расстояние 2,82A

3.Пример дисульфидного мостика

На рисунке представлен пример дисульфидного мостика в молекуле инсулина. Между 20 остатком цистеина цепи А и 19 остатком цепи В. В моем белке такие взаимодействия отсутствуют.