Задание 1
| seq1 | – | V | P | N | A | R | V | A | R | L | I | L | E | D | L | V | E | A | N | K | D |
| seq2 | C | M | P | N | A | R | V | A | R | L | N | L | E | D | E | E | Q | R | K | K | D |
| Вес | –12 | 1 | 7 | 6 | 4 | 5 | 4 | 4 | 5 | 4 | –3 | 4 | 5 | 6 | –3 | –2 | 2 | –1 | 0 | 5 | 6 |
Вес выравнивания: 59
Задание 2
Забавно, что и выравнивание, и вес совпали.Задание 3
В частичное выравнивание вошли с 4 по 441 и со 2 по 439 аминокислотный остаток для первой и второй последовательности соответственно.Локальное выравнивание не совпадает с "ограничением" глобального на эти участки, например в локальном К(4) соответствует К, S(5) соответствует K, а в глобальном этим же буквам соответствует gap.
Глобальное выравнивание имеет меньший вес (1723,5 против 1725 в локальном). Это обусловлено тем, что глобальное выравнивание включает в себя концевые участки, которые могут значительно отличаться.
Задание 1*
Задание 2*
Программой было сделано 5 альтернативных выравниваний, первое длиной 438 идентичностью 72,4%. А вот остальные четыре значительно меньше (длиной 19, 13, 22, 17) как и длина, их процент идентичности близки друг к другу (36,8%, 46,2%, 36,4%, 35,3%)Выравнивания