Занятие 5. Выравнивание последовательностей

     

Задание 1.

Выравнивание пары коротких последовательностей:
Полученое выравнивание

Процент идентичности: (13/21)*100=61,9%
Процент сходства: (15/21)*100=71,43%

Задание 2.

Координаты последовательности seq1: с 386 по 400

Задание 3.

Я сравнивала 6-фосфо-альфа-глюкозидазу из Bacillus subtilis(мой белок) и из Klebsiella pneumoniae(похожий белок).
Процент идентичности 73%; процент сходства 86%.
Число гэпов 0.
Координаты выравненного участка 4 - 441


Дополнительное задание.

Так как белки имели один выравненный участок (почти во всю длину последовательности), то воспроизвести выравнивание вручную оказалось совсем не сложно.