Сбор информации о ферменте PERL_HUMAN
EC=1.11.1.7
| Код | Расшифровка | Ферментативная активность (по GO) | |
| по-английски | по-русски | ||
| 1 | Oxidoreductases | Оксидоредуктазы | Катализирует реакции, лежащие в основе биологического окисления и сопровождающиеся переносом электронов с одной молекулы (акцептора протонов или донора электронов) на другую (донора протонов или акцептора электронов). |
| 1.11 | Acting on the CH-OH group of donors | В качестве донора СН-ОН группа | В роли акцептора выступает перекись |
| 1.11.1 | Peroxidases | Пероксидазы | Катализируют внутримолекулярный перенос фосфата с одной позиции на другую. |
| 1.11.1.7 | peroxidase | Пероксидаза | Катализирует реакцию: phenolic donor(фенольный донор) + H2O2 = 2 phenoxyl radical (2 фенольных радикала) of the donor + 2 H2O |
Насколько сохраняется функция фермента у белков со сходными последовательностями
По запросу было найден 541 белок, из них уже по второму числу совпал всего 21, 20 из них совпали по третьему, с EC=1.11.1.7 нашлось 2 белка PERE_MOUSE и PXDN_MOUSE.
В выдаче программы blastp (e-value 10 по умолчанию) оказалось 10 белков. Из них
первые 4 можно считать гомолагами, так как в остальных случаях выравнены лишь короткие фрагменты.
К сожалению по данным этой таблицы нельзя выявить корелляцию между функцией и позицией в выдаче,
так, например, у EC 1.11.2.2 e-value меньше, чем у EC 1.11.1.7(который пренадлежит моему ферменту).