Описание семейства доменов Coronavirus spike glycoprotein S2, intravirion

AC PF19214
ID CoV_S2_C
Число последовательностей seed 31
Число последовательностей full 63
Число доменных архитектур 5

S-белок - белок коронавирусов, участвующий в проникновении в клетку.

Домен S2 участвует в закреплении S-белка в мембране: для этого он содержит много остатков цистеина, к которым присоединяются жирные кислоты - пальмитиновая и стеариновая. Они заякоривают S-белок в мембране.

Распространённость архитектур

Архитектура Число последовательностей
CoV_S1, CoV_S1_C, CoV_S2, CoV_S2_C 33
bCoV_S1_N, bCoV_S1_RBD, CoV_S1_C, CoV_S2, CoV_S2_C 20
bCoV_S1_N, CoV_S1_C, CoV_S2, CoV_S2_C 4
CoV_S2, CoV_S2_C 3
CoV_S1_C, CoV_S2, CoV_S2_C 3

Множественное выравнивание

Выравнивание с Clustal-окраской

Максимально достоверный блок, включающий все последовательности - 1-9.

Максимальный достоверные блоки, включающие не все последоавтельности: 1-19, 29-33 и 61-66

S-белок подвержен быстрой эволюции, потому, не смотря на то, что блоки выделяются плохо и не консервативны, белки можно считать гомологичными.