Поиск в нуклеотидных банках по аннотации. Выравнивание геномов

Для построения карты локального сходства были взяты хромосомы из референсных геномов Shigella flexneri и и Escherichia coli O157:H7. Шигеллы - таксон внутри эшерихий, гены, отвечающие за вирулентность, находятся на плазмидах, поэтому хромосомы шигелл и эшерихий относительно схожи.

Карта локального сходства, построенная на megablast. По оси х - хромосома шигеллы, по у - хромосома кищечной палочки.
Карта локального сходства, построенная на blastn. По оси х - хромосома шигеллы, по у - хромосома кищечной палочки.

В области 250-350К лежит невыровнявшийся участок. В области 600-700К лежит инверсия. Между 1000К и 1500К лежат несколько делеций. В области 1400К-1900К лежит участок, на котором инверсия произошла дважды. В области 4200К-4500К лежит транспозиция с инверсией. Перед ней лежит простая инверсия(отделена небольшим участком выровнявшегося генома)