Примеры разных контактов в молекуле белка Thie_Bacsu
- Пример гидрофобного контакта между аминокислотным остатком Phe30:A и неполярными атомами углерода окружающих его а.о.
- Примеры водородных связей между боковыми группами
- Пример дисульфидного мостика
Связь между атомами кислорода
Связь между атомами азота
Здесь мы видим, как водородная связь между атомами азота боковых групп аминокислот Arg1225 и Gln1229 цепи B обеспечивает устойчивость реверсивного поворота.
(по непонятной причине, несмотря на то, что в PDB файле белок описан, как состоящий из двух идентичных цепей, в цепи A при использовании RasMol аналогичная связь отсутствует)
Т.к. в молекуле моего белка отсутствуют дисульфидные мостики, то привожу пример таковых из молекулы инсулина
Дисульфидные мостики могут также быть изображены следующим образом:
