Главная страница Обучение Обо мне Ссылки

Визуализация молекул

После того, как структура загрузится, надо нажать две кнопки:

1. Запустить скрипт:

2. Продолжить исполнение скрипта:

Текст скрипта

Jmol output:


С помощью программы Jmol можно вычислить параметры химических связей в молекулах. Для антранилат-фосфорибозилтрансферазы были найдены параметры трех водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре белка. Полученные данные представлены в таблице № 1.

Таблица № 1. Водородные связи вторичной структуры антранилат-фосфорибозилтрансферазы
Атом OАтом NДлина связиУгол между водородной связью и остовным атомом СВторичная структура
[THR]334:A[THR]338:A0.321 нм133.5°α-спираль
[GLY]240:B[SER]237:B0.284 нм127.5°β-тяж
[LYS]158:B[ALA]161:B0.341 нм101.0°α-спираль


На страницу второго семестра

© Alexandra Boyko, 2014. Faculty of Bioengineering and Bioinformatics, MSU.