Главная страница Обучение Обо мне Ссылки

Химическое строение нуклеиновых кислот

Практикум заключается в изучении нуклеотидов и фрагментов нуклеиновых кислот с помощью программы ChemSketch. Результаты (т.е. изображения требуемых фрагментов) можно увидеть в отдельном файле nucl.sk2.

Задание 2.

Упражнение 1.

На рис.1 (и на первой странице файла Chemsketch) представлены 4 структуры, которые могут встречаться в нуклеиновых кислотах. Азотистое основание урацил присуще РНК, поэтому для построения структуры уридина и псевдоуридина в качестве сахара была взята рибоза. Гуанин относится к пуриновым основаниям, тимин - к пиримидиновым, так что на этих примерах становится понятно, что пурины соединяются N-гликозидной связью 9-ым атомом цикла с 1' углеродом сахара, а пиримидины 1-ым азотом с C1' сахара. Кроме этого, показана разница между N-гликозидной и гликозидной связями. Первый вид связи, как следует из названия, соединяет N основания и C рибозы/дезоксирибозы, а второй вид связи возникает между С основания и С сахара.

Рис. 1. 2'-дезоксигуанозиндифосфат, 2'-дезокситимидинмонофосфат, уридин, псевдоуридин. Атомы азотистых оснований и сахаров (дезоксирибозы, рибозы) пронумерованы. Красным отмечены N-гликозидные связи между азотистыми основаниями и сахаром, а также гликозидная связь между урацилом и рибозой в псевдоуридине.

Упражнение 2.

На рис.2 изображен фрагмент двойной цепи ДНК (на плоскости). В файле Chemsketch-a он же приведен на второй странице.

Рис. 2. Фрагмент двойной цепи ДНК.Зеленым цветом подписаны азотистые основания, сахарофосфатный остов выделен красным цветом. Указаны 5'- и 3'-концы, направления цепей указаны стрелками.

На страницу третьего семестра


© Alexandra Boyko, 2014. Faculty of Bioengineering and Bioinformatics, MSU.