Занятие 5: Онтология
Задание1: Определение метаболических путей, в которых участвует данный фермент
По KEGG-идентификатору hsa:2936 был найден следующий метаболический путь:
hsa00480: Glutathione metabolism (метаболизм глутатиона)
[Глутатион - это трипептид γ-глутамилцистеинилглицин. Глутатион содержит необычную пептидную связь
между амино-группой цистеина и карбокси-группой боковой цепи глутамата. Важность глутатиона в клетке определяется
его антиоксидантными свойствами.]
Задание 2: Поиск структурных формул заданных соединений
| ID | Русское название | Английское название | Структура |
| C00078 | L-триптофан | L-Tryptophan | 
|
| C01598 | Мелатонин | Melatonin | 
|
Задание 3: Поиск метаболического пути от одного заданного вещества к другому
Карта: ko00380 Метаболизм триптофана
Путь: L-триптофан → Мелатонин
Задание 4: Сравнение метаболических путей разных организмов
| Организм | Цепочка реакций возможна |
Обоснование |
| Bacillus subtilis | неизвестно | неизвестны гены ферментов, катализирующих все стадии перехода |
| Archaeoglobus fulgidus | неизвестно | неизвестны гены ферментов, катализирующих все стадии перехода |
| Arabidopsis thaliana | неизвестно | неизвестны гены ферментов, катализирующих все стадии перехода |
| Homo sapiens | да | присутствуют все ферменты, необходимые для осуществления цепочки реакций |
Карта для пути в Homo sapiens:
E-mail: yan1303@yandex.ru
Официальный сайт ФББ
Ваши предложения :)))
Проекты
Главная страница