Вторичная структура PURR BACSU



α-спираль (а.о. с 36 по 54)








β-лист (а.о. с 225 по 230, с 247 по 253, с 263 по 266 )



Количество альфа-спиралей...45
Количество бета-складок...75
Количество бета-поворотов...95

В цепи А моего белка чередуются α и β структуры, поэтому я бы отнесла ее к типу α+β.


Для исследования выбраны элементы вторичной структуры:
α-спираль 36-54 (номера а.о),
параллельные β-тяжи 225-235 и 247-253 (номера а.о),
антипараллельные β-тяжи 68-73 и 57-62 (номера а.о),
β-поворот 63-67 (номера а.о),
Паттерн водородных связей Н(i,i+4). Но надо заметить, что от атома кислорода 36-го остатка отходят 2 водородные связи: к атомам азота 39-го и 40-го остатков.
Cβ-атомы расположены по спирали.
Cβ-атомы располагаются в плоскости, перпендикулярной плоскости β-листа, поочередно выходя за плоскость и из нее.

Ниже: β-лист






Реверсивный поворот




Выбранный поворот: PRO63-GLY64-ALA65-ALA66-GLY67
Данную петлю скрепляет водородная связь (от атома кислорода 64-го остатка глицина к атому азота 67-го остатка глицина)










































E-mail: yan1303@yandex.ru
Официальный сайт ФББ
Ваши предложения :)))
Проекты
Главная страница
Первый семестр



©Шарапова Яна