Практикум 3:
Данная молекула (PDB 3E2D) является белком, более того является ферментом класса гидролаз, большой хладоактивной Щёлочной Фосфатазой. Щёлочная фосфатаза представлена в виде гомодимера. Фермент состоит из двух цепей A и B, с идентичной последовательностью и структурой. Данная макромолекула относится к бактериям таксона Vibrio.sp. Uniprot ID: Q93P54 · Q93P54_9VIBR Функции (активности молекулы): 1. Связывание иона Zn2+ (кофактор) 2. Cвязывание ион Mq2+ (кофактор) 3. Фосфатазная активность. (высвобождение неорганического фосфата посредством гидролиза фосфоэфирной связи)
При выравнивании сиквенса из базы данных Uniprot c исходной последовательностью, выявлено что у исходного сиквенса отсутствует N-концевой пептид MKPIVTAVVTSTLSFNVLS, присутствующий у сиквенса из базы данных Uniprot. Модифицированные аминокислотные остатки отсутствуют.
Малые молекулы:
1. SO4 SULFATE ION
2. ZN ZINC ION
3. EDO 1,2-ETHANEDIOL
4. MG MAGNESIUM ION
